Los virus del dengue, papiloma humano, sarampión y decenas más, no sólo tienen en común que afectan negativamente a la población humana, sino que todos coinciden en valerse de las células del organismo infectado para replicarse y formar cientos de copias de sí mismos, ya que no pueden hacerlo ellos solos, y así continuar la infección.
Con el objetivo de generar estrategias novedosas para detener el ciclo vital de esos patógenos y contener la infección, un grupo multidisciplinario del Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (Cinvestav) estudia la propiedad biofísica que tienen los virus, para ello utiliza el supercómputo, el Big Data y las matemáticas.
De acuerdo con el doctor Mauricio Carrillo Tripp, investigador principal y jefe de grupo del Laboratorio de la Diversidad Biomolecular del Cinvestav Unidad Monterrey, a partir de una serie de análisis bioinformáticos en torno a las capas externas de los virus, conocidas como cápsides, han podido comprender sus características evolutivas y estructurales, y ahora buscan alternativas para contener las infecciones causadas por virus.
La cápside es una cubierta formada por proteínas que protege al patógeno y ayuda a transportar el genoma viral de una célula a otra. Además, contiene la “llave de entrada” que permite al virus ingresar a las células, donde se produce la replicación. Esto, aunado al proceso de autoensamblaje promueve una infección más amplia, por lo que el entendimiento de los mecanismos moleculares involucadros podría ser la clave en la lucha contra las infecciones.
Las cápsides de algunos virus se han usado ya como vacunas, tal es el caso de la polio y la hepatitis B. Sin embargo, nosotros no buscamos eso sino una estrategia alternativa a través de antivirales que inhiban la formación de los virus
Para el también miembro del Sistema Nacional de Investigadores, comprender las reglas que siguen las proteínas de cubierta para autoensamblarse y poder constituir la cápside con el tamaño y forma correcta de acuerdo a las características del virus, sigue siendo una de las interrogantes que lo han motivado a crear herramientas de análisis como CapsidMaps y un modelo computacional llamado CapsidMesh a fin de analizar la cápside en su totalidad sin sacrificar la resolución del nivel atómico.
Gracias a CapsidMesh, desarrollado en conjunto entre el Cinvestav Unidad Monterrey y los doctores Salvador Botello Rionda y Rafael Herrera Guzmán, del Centro de Investigación en Matemáticas (CIMAT, Gto.), los investigadores han podido realizar simulaciones numéricas con las que son capaces de identificar dónde muestran debilidad las estructuras de las cápsides de los virus, y de esa manera poder desarrollar nuevas alternativas terapéuticas con mayor eficiencia para cada tipo de patógeno.
“Tomamos las herramientas numéricas que usualmente se emplean para realizar análisis mecánico y de resistencia de materiales de estructuras como puentes, rascacielos, aviones y automóviles, y las aplicamos a las cápsides de virus”, puntualizó.
